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LASSAP, acronyme de LArge Scale Sequence compArison Package, est un logiciel de comparaisons de séquences nucléiques et protéiques. Il modèlise le processus global de comparaison de séquences et définit un cadre d'exécution parallèle, extensible en termes d'algorithmes, de structures de données et de contrôle de flot.

LASSAP est un système ouvert, organisé en modules, qui offre au programmeur la possibilité d'ajouter rapidement un nouvel algorithme, via une API (Application Programming Interface) sans avoir à se soucier de la programmation du flot de contrôle et des entrées/sorties. LASSAP implémente les algorithmes standards de comparaison de séquences, des algorithmes de ``string matching'' et de ``pattern matching'', ainsi que des combinaisons de ces algorithmes. Tout algorithme bénéficie de nombreuses valeurs ajoutées parmi lesquelles (i) des comparaisons intra et inter banque, (ii) des sélections dynamiques sur les banques, (iii) des sorties structurées, permettant d'aborder de manière pertinente les problèmes de classification, (iv) une implantation parallèle du flot de contôle des comparaisons.

LASSAP est diffusé, sous une forme binaire, par une procédure de ftp anonyme .